进化

有没有人对生命的分子进化感兴趣？

redondoself — Fri, 03 Oct 2008 05:27:15 -0700

可以浏览http://www.exploringorigins.org/这个网站。

基于“RNA世界”假说，从RNA分子从自折叠、自我复制、clay介导的RNA多聚化，到脂质分子的起源，自组装成脂质泡（双层脂分子形成的膜自发融合产生vesicles），脂膜的上脂分子运动活跃，脂质泡可以“生长”，最后由RNA和脂质分子组装成最原始的细胞。这些动画给我们提供了一副早期地球上生命诞生之初的分子进化图景。

作者简介：Animations and illustrations were made by Janet Iwasa, a 2006-2008 NSF Discovery Corps Postdoctoral Fellow, in collaboration with Jack Szostak and his laboratory at Massachusetts General Hospital, and the Current Science and Technology team at the Museum of Science. Movie narration was kindly provided by Tony Bell.

我已经转载到自己的博客上了，也欢迎访问。

http://blog.bioon.com/user1/2081/archives/2008/227103.shtml

http://blog.bioon.com/user1/2081/archives/2008/227104.shtml

http://blog.bioon.com/user1/2081/archives/2008/227114.shtml

http://blog.bioon.com/user1/2081/archives/2008/227115.shtml

http://blog.bioon.com/user1/2081/archives/2008/227116.shtml

下面是其中三段视频：

RNA折叠


RNA复制





活跃的脂质泡





生命科学



心理是什么？.0
kosmos — Wed, 21 Nov 2007 07:49:50 -0800
心理，何以成为我们要考虑的一个对象呢？
看到海水漫上来，我们说那是因为潮汐；

看到一个人走过来，我们说那是因为他愤怒。

这就是区别：我们都默认了人的行为的原因，是一种称为心理的东西。

那么人可以没有行为吗？一个物理对象静止，我们有可能忽略其静止的原因，但对于人，只有死人、以及类似死人的人，没有行为。活着的人，每个时刻都是处在行为之中，每个时刻我们都没法忽略其所处之行为。

因此，我们可以得到第一个结论：心理，是人类存在的一个必要环节。
然后，我们开始来合理地理解人类的行为，种种行为，以便逐步来了解心理这个对象。
首先，我们需要区分动作与行为。

动作，是依靠我们的运动机能来完成的，因此，动作对应的，只是我们的运动机能。

但，运动机能从进化的最开始，就不是自足的，（就不是孤立的，无意义的），而是服务于我们的生存的。
下面我们要开始触摸到“心理”最核心的概念之一：行为的作用域。
最早的多细胞动物（多孔动物门）能够在水中漂游，是因为那个生态位的存在，从而导致一个恰当的物种占据那个生态位。因此，它的运动机能，或者说，它的漂游行为，是由那个生态位决定的。

什么叫生态位？就是在一个具体的生态环境中，例如多孔动物门的海绵，作为最原始的多细胞动物，它的食物环境是预先存在的，就说明了可以成立一种动物，通过漂浮捕食而生存下来，自然选择之下，就塑造出来了该门物种。其特化的运动模式也就成为了该生态位的产物。

那么，我们可以说，海绵的行为模式（几乎等于其运动模式，也就是说随着进化，运动模式逐渐与行为模式呈现层次的差异）的作用域，就是其生态位：以其捕食与分布为主要内容。

海绵还没有特化的神经细胞与肌肉细胞出现，因此我们说其行为模式几乎就等于其运动模式，这也是由其生态位层次甚低有关，也就是它的捕食运动极端原始，并不需要多么特化的运动来完成捕食。
还是把进化的镜头拉到最近吧。
事件1：甲于8月8日晚在蓝低酒吧和乙一起喝酒聊天3小时。
事件2：甲于8月9日晚在蓝低酒吧和丙一起喝酒聊天3小时。
假设你是一个蓝低酒吧的伺应生，那么你能够从行为的意义上区分上述2个你所看到的事件吗？一般是不能的。
那么对于甲而言呢？假设乙是甲的一个客户，丙是甲的一个情人，一般我们就可以说，上述2事件是绝然不同的。
我们再不妨现在就观察一下自己：自己接下来的1小时要做的事情可能是什么？
1，想找本书看；
2，想躺一会儿；
3，想出去散步；
4，要约见一个朋友；
5，要约见一个生意伙伴；
6，要带子女买点什么；
7，要做午饭；
8，...
每一件事情，都有与其配套的行为，而那里面的每一个行为，都由一个相应的心理背景，或者说，行为的作用域，来支配。
我们先停一会儿，规范一下用语。（有点学究化，没感觉必要的可以略过。）
【辨析】事件与行为
事件是一个属于外部描述的概念，即，当我们描述一个对象时，必须概括出一个个的事件，作为我们描述的对象单位，事件之间可以有联系，但每个事件都是独一无二的，尽管事件可能有重复，比如售货员某天卖出4瓶洗发水，每一个卖出事件大体是雷同的。
行为，则是组成事件的单位，但行为这个概念，更多的是从主体的角度来叙述的，因此，完全不同的事件中可能存在极度相同的行为，例如上述甲的两个事件中，喝红酒的行为，是基本一致的。
忍不住先把本阶段的结论放在这里，主要是心理这个主题所需要摄纳的内容太狂野辽阔，我的关注点又常常游弋得快，所以先弄个结论在这里，就好像小时候的一个游戏：定一个大树，然后四散了到处捉迷藏，最终在没有被抓获的情形下跑回这棵树的话，就是胜利者。
我的结论是，人类面临着一个完全超迈于动物的生存局势，就是，必须首先越来越精粹地动用自己的从心理能力层面发育而出的精神能力，才能不懈地改善自己的行为的意义。
想必，这也是对知行问题所能够给出的终极答案。
我们的动作，有可能出现无意识的情况，但是，我们的行为，每一个行为，都是由意识或者心理主宰着的，与我们是否知道其心理的状态无关。
这一个稳固的机制，

是人类与其他动物发生实质性的区别的地方：由于我们拥有一个约略有边界的意识与心理区域，该区域进而延展为一个可能是无边界的精神之地域，在那广阔的区域

内可能的存在形式，塑造了我们人类的生存境况。
这种人类面临的崭新局势，很像是前面我们提到的海绵动物之所以出现的局势：存在那么一个生态环境，许可进而塑造了海绵这种生命形式的存在。
同样的，一个意识、心理、精神的空间，许可进而塑造着我们人类，延及于其行为。
http://s.kosmos.cn/


人类面对存在
kosmos — Sun, 07 Oct 2007 09:08:55 -0700

首先是有存在在那里。

对于那个存在，我们经由种群与个体的历史而拥有一些经验。

我们的经验告诉自己，这个宇宙并非一成不变，我们对这个宇宙的感知，如果把这本身看作是一个宇宙事件的话，该事件就一直是处于生发的进程中。

这，就是我们主要的处境。


这个处境的要点是，我们对那个存在的感知、认知、思想、...不管如何说，都属于那个生发中的事件进程。

关于那个事件进程的趋向，存在多种的说法，但不同说法之间的差异并不重要，重要的是，它们的相同的地方：都是以推进该进程为趋向。

那么推进该进程意味着什么呢？


其实，全力推进该进程，是人类这个物种最重大的进化选择。最初，人类选择智慧功能的增强，而不是选择其他生理功能的特异性增强，来作为对生境的应

对，例如攀援型的类人猿，选择的是特化自己双臂甚至尾巴的树枝间的攀援功能。当然，我这里说的选择，并非通常意义上的自我意志下的选择，而只是指一个现象

上表现出来的选择。

这么一直看下来，就知道，我们人类已经是走上了一条不归之路，我们愈是由这个选择获得物种优势，愈是更加凝练为自我意志下的选择，这，即是人类文明史以来，我们对于智慧、知识、精神等等，不懈追求的根本原因。

明白了这么一个历史的背景之后，我们就可以开始比较恰当地理解这个进程的实况了。


首先，有存在在那里，这是我们的一个最基本的认知要得以发生的初始条件，没有这个条件，就会导致认知紊乱，一种认知障碍甚至精神病变，这种病例是有案例可究的。

然后，就是我们自己与那个存在发生交互作用。


这个交互作用，是迄今为止人类最神秘的部位，但，如果我们从这个交互作用最原始的形态看下来，也并不是不可救药的神秘。

最原始的形态如何呢？随便就可以有很多例子，例如一条流浪狗，知道什么时候什么地点会有人给他喂食，就会定时定点等候。这个知道，与人类的知道，当然有不

可同日而语的地方，但也有本质一致的地方。我们所谓的掌握事物本质...不管用什么辞藻，都与狗的那个知道，是同一个方向的事情。

因此，我们完全可以暂时不涉及那个交互作用发生的细节，就一言以蔽之称呼为人类的感知。那个感知，永远是我们面对存在时的第一反应。

但，我们人类相比于狗，还发展了很多后续的技术，使得我们的感知得以迅速发展下来。


对于后续的技术，可以有精细的描述，也可以只做粗略的描述，但大体的环节是一致清晰的。

例如，可以使用王弼的那段话，“言出于象，故可寻言以观象；象生于意，故可寻象以观意。”就是说，感知所得到的就是意，由那个意生出象，大体上就是我们一

般所谓的概念，或心理态势。然后就是由象生出言，就是语言的叙述。这个顺序是对的，但有必要对于中间的环节予以进一步的阐述。


前面说了，我们面对存在的第一反应是什么，显然，有了那个第一反应，对于我们之所以要启动认知进程的目的是不够的。面对存在，我们最终需要的是通过我们的行为来实现自我的意志。

所以，现在，我们来看，如何从那个第一反应，走到那个最终目的，这是我们的一个完整的生存程序。


面对存在，产生第一反应，这个步骤显然是不可或缺、不可跳过的，而且，最关键的是，这个第一反应决定了我们全部后续成果的质量，因为，我们任何后续的技术，都无法增加我们除了第一反应之外对于存在的感知内容。

然后，我们对自己的感知，形成一个稳定的心理态势、意象与概念。

然后，我们使用所谓的语言，来表述我们的心理态势、意象与概念。

然后，我们的语言承担了个体之间交流的功能，也承担了记录的功能，或者说过去与未来之间的交流的功能，由此，我们能够迅速扩增我们的个体经验，从而回到我们的起点：我们因此而增强自己的第一反应的能力。


这样，我们就完成了一个完整的认知程序。

但，似乎我们还没有提到如何走到那个最终目的。人类的实况是，我们常常是，从上述的每一个环节出发，都可以启动行为的实现，以完成自我意志，差别只是，实现的不同程度和层面。


暂时不讨论上述过程的任何细节，但大概的框架就是如此。


最后，我们就可以把一般的疑惑放置到上述框架里面，而得到初步的澄清。


1，所谓体悟，无言等等，就是指我们的第一反应，大量的教义要求我们回到第一反应，其正当的理由在于，我们的第一反应决定了我们后续的一切认知成果。但很少得到阐明的是，那个第一反应的能力，应该如何得到实际的精进。

2，语言，仅仅只是一个承前启后的环节，其之所以给人类带来困扰，在于语言作为人类纯熟而清晰的功能，我们一般人很难把这个功能本身置于感知的对象位置。

3，人类的进化目的，是增强那个感知的能力本身，从而扩增人类在这个宇宙中的存在。

4，数学就是数学，不单纯是语言。

......

长途大巴


我们都是幸存者
kosmos — Thu, 15 Mar 2007 04:25:38 -0700
海德堡人，尼安德特人，小矮人，...我们曾经的同行者，都已经灭绝了。为什么？

据说，三万年前，我们在石洞壁上绘制的壁画，可能算是一个答案：我们因为具有超出此时此地的观看的能力，而使得我们能够在11万年前严酷的冰期环境压力下，更加具有生存技巧。

也就是说，因为杰出，所以幸存。
与我们同一个属但不同的种，都无法生存下来，如果不是纯属偶然，就是意味深长的。

向后看，人，作为一个单一的种，具有思维当中特定的某种能力，出现于生命物种的系列，其意义，足以与动物与植物的分化相比拟，甚至有过之。

但，如果向前看，生命之此种新能力的出现，还只是10万年左右的历史，相比于直立人1百多万将近2百万年的历史，我们的爆出，是一个什么涵义的预兆呢？
当然，幸存，并不是可以过分拔高的伟大事迹，因为更早期的同类，灵长类的猿猴，也都还有幸存者，再往下的物种，也还有大量的幸存者。

但是，人类思维能力的爆出，是否足以让我们应对将来的灾难？也就是说，我们能否一直幸存下去呢？
答案，也许只能从我们人之所以为人的特点里面寻找突破，也就是说：我们是否可以在人中杰出？
显然，如果我们承认以下几点：

1，在地球的环境里面，乃至在我们目前所知的所有类地行星里面，我们人类，是具有最高级生命形态的物种。

2，生命的进化不可能到人类出现就开始停滞。

3，目前比人类低级的物种能否反而进化出比人类更为高等的物种吗？如果不可想象此点，那么：

更高等的物种，只能出自我们这群人中间。
且慢，什么叫更高等？如果这个概念的涵义是足够清晰的话，那么有什么理由，我们可以认为进化必须具有如此方向？
鉴于大脑是生命进化的一个主要解决方案所在，那么，我们确实无法想象有哪种动物有可能获得新的大脑特性，足以使其跨越人脑对它业已形成的优势，因为在大脑的物种间比较中，比较容易获得进化的线性序列，这个线性的序列里面，高级就意味着新内容的累加。这个序列表明跳级几乎是不可能的，除非进化自身发现了另外一种全新的思维解决方案。
那么，进化的这个方向意味着什么呢？

这个问题也许等价于一个更好回答的具体些的问题：神经系统对于动物的意义。

粗略地说，神经系统越高级，动物对环境就能够有更多的应对行为。

因此，同样是应对寒冷，候鸟只有远徙，有些动物可以冬眠，而人类则可以生火穿衣以及建住房。
当然，目前的人类已勉强超脱了单纯地理环境与气候环境的制约，但我们并未超脱地球资源环境的制约，也未超出太阳系环境的制约，等等．．．所以，我们正在努力发展自己更高的能力，以便渐次超越那些制约，例如，获得更长久的能源，寻求地球之外的移居地，寻找关于太阳乃至宇宙命运的答案．．．
但，这就是我们主要的工作吗？

鉴于我们对科学的认识，才只有几百年的历史，我们并没有足够的自信，所有这些自以为是的工作日程安排，会是一直有效合宜的。

那么，我们可能的风险在哪里？
再问下去，开始有些超出我的能力，还是回到我们最古老的命题：

惟有杰出，才能幸存。
接下来的问题是：何谓杰出？