Mountain 推荐了 Mendeley,它是一个网站,同时也是一个桌面程序,可用来管理、分享文献资料。也有一定的社会性软件功能,比如通过兴趣找同行,等等。
试着用了一下,对我来说,Mendeley 最有用最特别的地方也许是可以自动提取 PDF 文档中的 Metadata 了。虽然常常不是太准,但至少有一部分正确输入了。似乎有希望把我的 PDF 库,作成一个数据库了。:)
试了一下它的 shared groups 功能,居然只能邀请 9 个人分享。似乎限制太大了一点,虽然一般情况下,9 个人的合作组已经够大了。
另外,一个值得一提的功能是,支持与 CiteULike 同步。它自己也有 Bookmarklet,可以从网页导入文献信息。
这类软件和网站服务越来越多,作为使用者真不知道该用哪个才好。万一判断失误,将来服务终止/软件停止开发之类,迁移成本还是很高的。
MIT 的教职员工们上周无记名投票通过了一项决议:允许校方免费公开他们撰写的学术文章。MIT 将创建一个在线储藏库来存放这些内容。
虽然斯坦福大学与哈佛大学的一些院系已经开始采用这样的政策,但 MIT 是第一个在整个学校范围内这样做的。
大学为什么要这么做?那是因为目前科学期刊出版存在许多不合理之处,举两个明显而实在的问题:一、出版商经常要求研究者们把他们的文章版权转交给他们;二、等研究者所在单位想获取这些文章时,出版商又要收取昂贵的订阅费。
加州大学和世界第二大学术出版巨头Springer(Springer Science+Business Media)达成了一项协议,同意开放获取加州大学作者的文章。根据协议条款,从2009年开始,Springer旗下杂志出版的加州大学作者文章将使用支持完整和即时开放获取的Springer Open Choice。每篇文章无需单独收费。文章将在创作共用兼容许可证下发布(by-nc:署名-非商业使用)。除了可以通过 Springer平台访问之外,最终出版的文章还将储存在加州数字图书馆的eScholarship Repository内。
加州大学包含十个校区:
加州大学柏克莱
加州大学戴维斯
加州大学哈斯汀法学院
加州大学尔湾
加州大学洛杉矶
加州大学美喜德
加州大学河边
加州大学圣地牙哥
加州大学旧金山
加州大学圣塔芭芭拉
加州大学圣塔克鲁兹
Springer每年出版超过1700期杂志和超过5500本新书:
主要杂志包括:
Advances in Therapy
Educational Studies in Mathematics
Formal Aspects of Computing
Innovations in Systems and Software Engineering
Journal of Orthopaedic Science
Mathematical Intelligencer
Mathematische Annalen
Primates
Theoretical and Applied Genetics
收到北京大学现代出版研究所李武的邮件,转发一下:
北京大学现代出版研究所正在主持一项调研项目——科研人员接受和使用开放存取知识库的影响因素,调研对象是从事教学和或研究的科研人员(包括在读博士研究生和博士后)。所以,我们郑重地邀请您参与此项调研。
到会各组织、成员及组织特色:
科学松鼠会:姬十三、Yami、猛犸、Gary;年轻而发展迅速的科普blog圈
煎蛋:杨光、帽子;有趣的科普内容译文聚合群体blog
奇迹文库:季燕江;早期做预印本和电子书,现在有做读书会(journal club)的想法
集智俱乐部:Jake;对系统科学及相关问题感兴趣,网上平台有网站、豆瓣组、blog和google group,线下活动丰富多样
格致:Harrison;聚焦科学技术的群体 blog,用户群体较年轻,成员当中海外学子和物理学专业者较多,组织较松散,网站技术较好,有一批关注科学2.0的成员
科学网:孙宁、何姣;中科院旗下《科学时报》的网上官媒,以科研立项方式获得资助,进行科学传播媒体的探索,其“科学网博客”教授和老师用户较多,但目前页面设计方面较陈陋,预计明年改版
关于格致的定位和特色问题的讨论:
1.季燕江老师提出,格致拥有很多海外成员,科学素养很高,但因为地缘上的分散性使得线下活动难以举行。但格致可以与参会的各网站和组织联系,通过合作来组织线下活动。
2.从igezhi.org和wordpress平台下诸多插件的开发来看,自号为“格致管道工”的桑葚技术基础非常好。但从目前格致的状况来看,瓶颈也许不在技术方面。
WikiGenes 是一个关于基因、化学物质、病理等等的 Wiki,它背后的系统叫 Mememoir。Mememoir 与 WikiPedia 背后的系统 WikiMedia 的主要不同在于,它着重集体写作的 wiki 文章的署名问题。从《自然》杂志上的文章和这个演示视频看到,文章中的每个词都链接到具体作者。WikiMedia 通过历史记录原则上也做到了这点,但没有 Mememoir 那么直观。除此之外一个重要特点是引入了针对作者的评价系统。
Solidot 的介绍:
科学界的Wiki——Mememoir 是一个全新的 Wiki,目前以 WikiGenes wiki 的形式进行开发。Wikigenes (Mememoir )是一个基因信息数据库,由 MIT 的访问学者,瑞士人 Robert Hoffmann 开发。对学术界的科学家来说,著述是他们的生命。在 Wiki 发表学术文章短期内未必会对他们的职称有多大影响,但 Mememoir 多少可以让作者出众,另外,Mememoir 还可以让读者对作者及其文章打分。Mememoir 的开发者还寻求将 Mememoir 开源的可能,Robert Hoffmann 说,这是后期会考虑事,目前正集中精力运行 Wikigenes 项目。 "
自然出版社在考虑开放 nature.com 上的评论功能。最近,他们拿到了 BioMedCentral (BMC) 5 年来网站上的评论数据,做了下简单的数据挖掘,得到一些不太激动人心的结果。
从 2002 年 11 月至 2008 年 7 月,所有的 BMC 期刊得到来自 753 个用户针对 732 篇文章的累计 945 个评论。BMC 总共出版了 37916 篇文章,所以只有 ~2% 的文章得到了评论。
有三分之一的评论来自作者自己:提供补充材料,指出文中的错误,或者回答别人的评论。只有 8% 的人评论了不只 1 篇文章。
那评论的内容都是些什么呢?看下图:

虽然评论数量稀少,不过自然出版社的帖子指出,评论的质量还是不错的,多数对文章有所助益。“沙发、板凳”类评论只占到 8 %。
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这个结果不太激动人心,但也不意外,很容易理解的。
1、只有作者才会觉得有义务去更正错误,回复读者的评论,等等。
2、要评论一篇学术论文,需要花很多精力(不然审稿人们为什么老会拖很久才递交报告呢?),不像回复 blog/论坛帖子那么容易。
3、如果真地对某篇文章非常有兴趣,并且有想法,人们可能也不会评论,因为要保密。
...
Public Knowledge Project(公共知识项目)是北美(主要是加拿大)一些大学机构的合作项目,目的是探索新技术是否以及如何改进学术研究的专业和公共价值,blah blah blah ⋯⋯ 这些只是套话,我只是想提一下它开发的开源项目之一: Open Journal Systems(OSJ 开放期刊系统)。它是一个期刊管理以及发布系统,提供从投稿,审稿,到在线发表以及索引,同行评议期刊整个发行过程的解决方案。
OJS Features
1. OJS is installed locally and locally controlled.
2. Editors configure requirements, sections, review process, etc.
3. Online submission and management of all content.
4. Subscription module with delayed open access options.
5. Comprehensive indexing of content part of global system.
6. Reading Tools for content, based on field and editors' choice.
7. Email notification and commenting ability for readers.
8. Complete context-sensitive online Help support.

因此,如果有搞一份比较正规的学术杂志的想法,至少软件是有了。虽然这种正规的学术期刊体系不够二(就是 2.0),但 OSJ 降低了创办学术期刊的成本,正如开源 blog 软件降低了个人网络出版的门槛,开放期刊系统对于推动开放获取,开放科学,等等科学 2.0 想法应当是有价值的。学术出版不应当只为少数几个出版机构掌握。
原文:High-Energy Physics Labs Join to Build a New Scientific Information System
译者:葛韶锋
来源:奇迹
来自德国汉堡的消息:欧洲核子中心(CERN: The European Organization for Nuclear Research)、德国电子加速器中心(DESY: Deutsches Elektronen-Synchrotron)、美国费米国家实验室(FNAL: Fermi National Accelerator Laboratory)以及斯坦福直线加速器中心(SLAC: Standord Linear Accelerator Center)宣布他们将联合打造下一代高能物理信息系统INSPIRE(目前高能物理学界使用最多的学术搜索平台是SPIRES),这一系统将在大型强子对撞机(LHC: Large Hadron Collider)即将开启粒子物理学新纪元之前为全世界的科学家提供强有力的创新性研究工具。
这一宣言是在第二届粒子物理和天体物理信息专家峰会——五月二十、二十一日于德国电子加速器中心召开——上作出的。参加这一峰会的是来自以上四个实验室以及其它信息提供机构——包括康奈尔的arXiv网站以及史密松森天体物理台(SAO: Smithsonian Astrophysical Observatory)-美国宇航局(NASA: National Aeronautics and Space Administration)共同建立的天体物理数据系统(ADS: Astrophysical Data System)——的代表以及一些主要的出版商。
Rolf-Dieter Heuer是德国电子加速器中心负责科研的主管,同时他已经被选为欧洲核子中心的新一任主管,他在会上发表演讲的时候说:“INSPIRE承诺将解决日益增长的信息需求并将通过先进的信息发掘能力提高科学研究的效率。