格致

《大学》里的这段话，影响了上千年中国知识阶层的思路，也是费正清多次引用、说明传统中国学问缺少逻辑的例子：
“古之欲明明德于天下者，先治其国，欲治其国者，先齐其家；欲齐其家者，先修其身；欲修其身者，先正其心；欲正其心者，先诚其意；欲诚其意者，先致其知，致知在格物。物格而后知至，知至而后意诚，意诚而后心正，心正而后身修，身修而后家齐，家齐而后国治，国治而后天下平。自天子以至于庶人，壹是皆以修身为本。”

设想一下，在一个等级森严的环境里，一个宿儒向你抑扬顿挫地宣讲这样一番话，那是有着何等的震撼力！然而这一切不过是个文字游戏。每一个链条之间都没有逻辑的连接，仅仅是无法证明的空洞的预设。“为什么治国要先齐家？某个人去格一绰竹子就天下太平了么？“如果你真的这样问了，等待你的多半是一顿板子；如果你”执迷不悟“，结局多半是孺子不可教也，扫地出门。不是说你真的会被赶出教堂，而是你会被终身流放到体制之外。

到了明朝的一天，一个叫戴震的小孩子问了老师，一两千年后的朱熹是怎么知道某句话是孔子说的呢？后来戴震成了名人，这件事也成了佳话。这件事不寻常的地方在哪里呢？

好奇和提问是儿童的天性。如果不受到体制性的压抑，多数小孩都问得出这种问题。在同一个时代，有多少个小孩有戴震这种读书机会呢？读书的小孩有多少个被一通板子打回去了呢？剩下的小孩有几个在科场和官场中存活下来了呢？戴震当然是个聪明人，但是在“戴震难师”的故事中，最不寻常的一点不是他的聪明 ——天下聪明人多着呐——最不寻常的一点是他比多数人幸运。

著名物理学旗舰杂志《物理评论快报》不允作者将来自其出版论文的材料递交到维基百科或写到博客上。最近，杂志撤消了两篇已接受的论文，Jonathan Oppenheim和其他共同作者要求论文的版权协议应该与 Wikipedia和Quantum Wikipedia保持一致。目前许多科学家“像例行公事般的做违反与杂志签署的版权转让协议的事”。38位物理学家写信给杂志社要求修改版权政策，认为“它是不合理的，完全与科学领域的做法有差别。科学家都希望让尽可能多的人阅读他们的论文”。抗议可能起了些效果，美国物理学会杂志主编表示学会将在5月份的会议上重新评论版权政策，他说“一些优秀的科学家要求我们考虑修订版权，我们会认真对待”。via: solidot

//鼓掌

PLoS Computational Biology 从 2005 年开始做了个 Ten Simple Rules for ... 系列文章，作者主要是主编 Philip E. Bourne，有时候是和人合作。

• 如何做出最好的研究工作
• 如何让你的成果发表
• 如何拿经费
• 如何做审稿人
• 如何选择博士后位置
• 如何成功和他人合作
• 如何做一个好的口头演讲
• 如何做一个好的挂图演讲

PLoS的期刊都是全文免费开放的，你可以阅读下载，你也可以自由把它们翻译成中文发布，只要表明作者和出处。

这些文章很值得一读，即使看完了做不到，但心里有个印象也是有用的。很少有导师能教学生这些。

via：马跃

另外，德国之声的中文网志：芒人摸象，报导了格致。和很多人一样，想当然地认为格致是科普网站。

格致不是科普网站，可能偶尔有些科普文章，但科普不是格致的主要目标。

受《大众机械》杂志的帖子：“25 项每个男人应该会的技能”（中文翻译）的影响，前一段时间很多 blogger 都在列类似的单子。Chad Orzel 列过一个“每个科学工作者都应该会的 N 项技能”，挺有意思的。

一个科学工作者应该会：

1、设计和进行简单的实验；
2、构造和验证简单的理论模型；
3、使用电脑（留言里有人补充：不只是 Windows 的 :P）；
4、解释图表；
5、懂代数；
6、计算和解释一些基本的统计值（平均值，中值，标准差，等等）；
7、理解基本的微积分；
8、写技术文章解释结果；
9、写项目申请；
10、用通俗的语言解释你的工作；
11、做一个小时长的研究报告；
12、阅读和评价同领域别的科学工作者的文章；
13、阅读和评价非自身领域的大众科学文章；

文章留言里有人提了一些，我觉得这几条不错：

14、使用图书馆，数据库；
15、指导学生后辈；
16、说“不知道”。

还有那些应该补充呢？

很早以前就听说过John Holland这个名字了，因为他的遗传算法在国内学术界早已经闻名遐迩。然而，通过阅读《隐秩序》这本书才让我了解到，John Holland的学术贡献不仅仅是遗传算法这样一个比较狭窄的算法领域，而是一个全新的学科复杂适应系统CAS，甚至是一种西方科学思想的全新世界观：一种进化的、适应性的、柔性的世界。

1、基本元素

纽约市中心的普通的一天，小女孩彼得逊走进了她喜欢的商店，直奔一排货架，毫不犹豫地拿起了一瓶她喜欢吃的腌鲱鱼……。然而小女孩从不用担心她喜欢的东西不在那，因为全世界的超级市场几乎都可以精确地把居民需要的成千上万的形形色色商品送到市场中、货架上。也许我们对这一现象早已经司空见惯，然而仔细思考里面却存在着一个很大的谜题：是谁安排了这一切呢？是什么机制使得那么多商品恰到好处地供应到货架上？经济系统为什么可以自发调节？

从这样一个司空见惯的小事情，John Holland开始引领我们进入了CAS（复杂适应系统）的世界。接下来，Holland开始展现它非凡的知识和才华，从免疫系统到神经网络，从股票市场到热带雨林。哇，原来CAS的胃口这么大，它面向的不再是一两个数学定理的证明和无穷、繁琐的生物学实验，而是我们这个大千世界，一个几乎涉猎所有学科的广阔学术空间。

配有图片和超连接的原文文章请看这里：
http://www.swarmagents.com/complex/complexsys/flow.htm

“流”的探索

张江

2007.8

流动是复杂系统中的普遍现象之一，从看得见的流动，例如：水流、人流；到看不见的流动，如：电流、能量流、热流；再到更加抽象的：货币流、信息流等等，似乎如果一个系统是复杂的，它的内部就一定存在着各种流动。那么是否存在着某个普遍的规律制约着这些流动呢？答案应该是肯定的，虽然这种规律仍然“犹抱琵琶半遮面”，但是近年来有关生态学、非平衡态统计物理的研究已经逐渐逼近它，各种迹象表明，一种统一的可以描述复杂系统中“流动”现象的通用规律即将“横空出世”。我们为什么会衰老和死亡？大象为什么比蟑螂吃得多而繁殖得少？少数大公司为什么能垄断市场？城市的交通网络为什么与动物体内的血管那么相似？也许这些问题最终都能在这套新理论中找到答案。本文的目的就是想引领读者赶上复杂性研究前沿的步伐，亲身体验这些激动人心的科学发现。

本篇文章分为三章： 一、流动与幂律 二、分形输运网络 三、通向理论

一、流动与幂律

1、流量与存量

Michael Nielsen 最近又开始活跃地 blog 起来。最近一个帖子提到，他也在考虑网络对科学的影响，并已经开始起草一本相关的书，在未来几个礼拜内会贴出一个摘要。摘要将谈到这些内容：

Micropublication（微发表）: Allowing immediate publication in small incremental steps, both of conventional text, and in more diverse media formats (e.g. commentary, code, data, simulations, explanations, suggestions, criticism and correction). All are to be treated as first class fully citable publications, creating an incentive for people to contribute far more rapidly and in a wider range of ways than is presently the case.

Open source research（开源研究）: Using version control systems to open up scientific publications so they can be extended, modified, reused, refactored and recombined by other users, all the while preserving a coherent and citable record of who did what, and when.

The future of peer review（同行评议的未来）: The present quality assurance system relies on refereeing as a filtering system, prior to publication. Can we move to a system where the filtering is done after publication?

Collaboration markets（合作市场）: How can we fully leverage individual expertise? Most researchers spend much of their time reinventing the wheel, or doing tasks at which they have relatively little comparative advantage. Can we provide mechanisms to easily outsource work like this?

Select ratingCancel ratingPoorOkayGoodGreatAwesome

Your rating: None

The Coming Revolution in Scholarly Communications & Cyberinfrastructure, CTWatch Quarterly 07年8月期。可全文阅读，内容包括：

Introduction
Lee Dirks, Microsoft Corporation
Tony Hey, Microsoft Corporation

The Shape of the Scientific Article in The Developing Cyberinfrastructure
Clifford Lynch, Coalition for Networked Information (CNI)

Next-Generation Implications of Open Access
Paul Ginsparg, Cornell University

Web 2.0 in Science
Timo Hannay, Nature Publishing

Reinventing Scholarly Communication for the Electronic Age
J. Lynn Fink, University of California, San Diego
Philip E. Bourne, University of California, San Diego

Science 上一篇文章：The Scientific Research Potential of Virtual Worlds。via：姬十三

Online virtual worlds, electronic environments where people can work and interact in a somewhat realistic manner, have great potential as sites for research in the social, behavioral, and economic sciences, as well as in human-centered computer science. This article uses Second Life and World of Warcraft as two very different examples of current virtual worlds that foreshadow future developments, introducing a number of research methodologies that scientists are now exploring, including formal experimentation, observational ethnography, and quantitative analysis of economic markets or social networks.

听起来挺有趣的。记忆中，已经有过不少以社会性软件为对象的研究论文了。自己做一个网站，然后以它的统计数据来发表研究论文，这似乎挺酷的。

一个相关的信息，也许有人还不知道：如果想在 second life 上做一点科学相关的探索，可以联系自然出版社，他们可以给你一点 second life 的土地。说明在这里。

自然出版社又发布了一个新网站：Nature Precedings，a place for researchers to share pre-publication research, unpublished manuscripts, presentations, posters, white papers, technical papers, supplementary findings, and other scientific documents. 类似物理科学领域的 arXiv。

The traditional way for scientists to share their research results is through journals. These have the benefit of being peer-reviewed, citable and archival, but as a communication channel they are also relatively slow and expensive. As a complement to this, scientists also use more immediate and informal approaches, such as preprints (i.e., unpublished manuscripts), conference papers and presentations. The trouble is, these usually aren't easy to share in a truly globally way (most repositories are institution- or funder-specific), and you can't formally cite them (which is important because citation underlies the scientific credit system).

Nature Precedings is trying to overcome those limitations by giving researchers a place to post documents such as preprints and presentations in a way that makes them globally visible and citable. Submissions are filtered by a team of curators to weed out obviously inappropriate material, but there's no peer-review so accepted contributions appear online very quickly -- usually within a couple of hours. The content is all released under a Creative Commons Attribution License, and each item is made citable using a DOI or Handle (the same systems used for peer-reviewed scholarly papers).

Select ratingCancel ratingPoorOkayGoodGreatAwesome

Your rating: None